Do zakresu zadań Działu Finansowo-Księgowego należy prowadzenie spraw finansowych i księgowości Muzeum, organizowanie i realizowanie systemu wypłat wynagrodzeń, prowadzenie rachunkowości zarządczej, opracowywanie planów finansowych oraz sprawozdań o charakterze finansowym dla potrzeb zewnętrznych i wewnętrznych Muzeum, przygotowywanie okresowych analiz, raportów i sprawozdań, w tym finansowych z działalności Muzeum.